目前可以用于诊断原发性肝癌的生化检验指标只有甲胎蛋白(AFP)。甲胎蛋白最初用于肝癌的早期诊断，它在肝癌患者出现症状之前8个月就已经升高，此时大多数肝癌病人仍无明显症状，这些患者经过手术治疗后，预后得到明显改善，必要时要多次复查。判断肝功能好坏的标准有以下四个。
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反映肝脏分泌和排泄功能的项目
如果同时测定TBil和DBil，可以鉴别诊断溶血性、肝细胞性和梗阻性黄疸。溶血性黄疸：一般TBil<85&mumol/L，直接胆红素/总胆红素<20%肝细胞性黄疸：一般TBil<200&mumol/L，直接胆红素/总胆红素>35%阻塞性黄疸：一般TBil>340&mumol/L，直接胆红素/总胆红素>60%。
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